Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RfflQ6ZQM0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms