Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc57Q6PHN1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc57Q6PHN1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms