Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pou4f3Q63955 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou4f3Q63955 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms