Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Odf1Q61999 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Odf1Q61999 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Odf1Q61999 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Odf1Q61999 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Odf1Q61999 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Odf1Q61999 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Odf1Q61999 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Odf1Q61999 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Odf1Q61999 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Odf1Q61999 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Odf1Q61999 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf1Q61999 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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