Protein–RNA interactions for Protein: Q61189

Clns1a, Methylosome subunit pICln, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clns1aQ61189 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clns1aQ61189 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clns1aQ61189 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clns1aQ61189 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clns1aQ61189 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clns1aQ61189 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clns1aQ61189 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clns1aQ61189 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clns1aQ61189 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms