Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trdv2-2Q5R1A4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms