Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL13

Gm527, Uncharacterized protein C14orf28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm527Q4KL13 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm527Q4KL13 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm527Q4KL13 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms