Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dtx3lQ3UIR3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms