Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lmod2Q3UHZ5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms