Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc177Q3UHB8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms