Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
XylbQ3TNA1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms