Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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