Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Calb2Q08331 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Calb2Q08331 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms