Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CkbQ04447 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CkbQ04447 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CkbQ04447 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CkbQ04447 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CkbQ04447 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CkbQ04447 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CkbQ04447 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CkbQ04447 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms