Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1cQ01815 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1cQ01815 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms