Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd13P70217 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd13P70217 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms