Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csrnp3P59055 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csrnp3P59055 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms