Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sh3bp1P55194 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sh3bp1P55194 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms