Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

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Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp9P49962 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp9P49962 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp9P49962 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp9P49962 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Srp9P49962 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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