Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb1P28230 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gjb1P28230 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms