Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccnd1P25322 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnd1P25322 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms