Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PdgfaP20033 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PdgfaP20033 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms