Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs1P17533 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa-rs1P17533 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms