Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms