Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TtrP07309 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TtrP07309 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TtrP07309 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TtrP07309 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TtrP07309 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TtrP07309 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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TtrP07309 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TtrP07309 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TtrP07309 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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TtrP07309 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TtrP07309 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TtrP07309 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TtrP07309 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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TtrP07309 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TtrP07309 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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TtrP07309 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TtrP07309 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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TtrP07309 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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TtrP07309 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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TtrP07309 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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TtrP07309 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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TtrP07309 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtrP07309 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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TtrP07309 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtrP07309 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtrP07309 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtrP07309 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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