Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgfb1P04202 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tgfb1P04202 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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