Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl25O35903 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl25O35903 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl25O35903 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl25O35903 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl25O35903 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl25O35903 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl25O35903 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl25O35903 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl25O35903 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl25O35903 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl25O35903 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl25O35903 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl25O35903 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl25O35903 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccl25O35903 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccl25O35903 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms