Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc23O35125 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc23O35125 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc23O35125 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc23O35125 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc23O35125 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc23O35125 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc23O35125 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc23O35125 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc23O35125 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc23O35125 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc23O35125 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc23O35125 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc23O35125 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc23O35125 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc23O35125 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc23O35125 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc23O35125 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc23O35125 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc23O35125 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc23O35125 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc23O35125 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc23O35125 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc23O35125 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc23O35125 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc23O35125 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc23O35125 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc23O35125 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc23O35125 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc23O35125 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms