Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Gm17577J3QNF7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Gm17577J3QNF7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Gm17577J3QNF7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17577J3QNF7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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