Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r76F8VQ63 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r76F8VQ63 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms