Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gm8220F6YKI2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8220F6YKI2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8220F6YKI2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8220F6YKI2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8220F6YKI2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8220F6YKI2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8220F6YKI2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8220F6YKI2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8220F6YKI2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8220F6YKI2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8220F6YKI2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8220F6YKI2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8220F6YKI2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms