Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Zfp558E9Q1J0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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Zfp558E9Q1J0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Zfp558E9Q1J0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Zfp558E9Q1J0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Zfp558E9Q1J0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Zfp558E9Q1J0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Zfp558E9Q1J0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Zfp558E9Q1J0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Zfp558E9Q1J0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Zfp558E9Q1J0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Zfp558E9Q1J0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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Zfp558E9Q1J0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp558E9Q1J0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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