Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms