Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z108

Stau1, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stau1Q9Z108 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stau1Q9Z108 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stau1Q9Z108 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Stau1Q9Z108 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Stau1Q9Z108 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stau1Q9Z108 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stau1Q9Z108 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stau1Q9Z108 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stau1Q9Z108 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stau1Q9Z108 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stau1Q9Z108 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stau1Q9Z108 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stau1Q9Z108 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stau1Q9Z108 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stau1Q9Z108 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stau1Q9Z108 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stau1Q9Z108 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stau1Q9Z108 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stau1Q9Z108 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stau1Q9Z108 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Stau1Q9Z108 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stau1Q9Z108 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stau1Q9Z108 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stau1Q9Z108 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stau1Q9Z108 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stau1Q9Z108 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Stau1Q9Z108 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stau1Q9Z108 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stau1Q9Z108 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stau1Q9Z108 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stau1Q9Z108 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stau1Q9Z108 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Stau1Q9Z108 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Stau1Q9Z108 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Stau1Q9Z108 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Stau1Q9Z108 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stau1Q9Z108 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stau1Q9Z108 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stau1Q9Z108 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stau1Q9Z108 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Stau1Q9Z108 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stau1Q9Z108 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stau1Q9Z108 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stau1Q9Z108 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Stau1Q9Z108 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stau1Q9Z108 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stau1Q9Z108 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stau1Q9Z108 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stau1Q9Z108 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stau1Q9Z108 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stau1Q9Z108 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stau1Q9Z108 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stau1Q9Z108 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stau1Q9Z108 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stau1Q9Z108 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stau1Q9Z108 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stau1Q9Z108 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stau1Q9Z108 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stau1Q9Z108 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stau1Q9Z108 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Stau1Q9Z108 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stau1Q9Z108 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stau1Q9Z108 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stau1Q9Z108 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stau1Q9Z108 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stau1Q9Z108 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stau1Q9Z108 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stau1Q9Z108 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Stau1Q9Z108 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stau1Q9Z108 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stau1Q9Z108 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stau1Q9Z108 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stau1Q9Z108 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stau1Q9Z108 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stau1Q9Z108 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stau1Q9Z108 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stau1Q9Z108 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stau1Q9Z108 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stau1Q9Z108 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stau1Q9Z108 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stau1Q9Z108 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stau1Q9Z108 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stau1Q9Z108 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stau1Q9Z108 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stau1Q9Z108 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stau1Q9Z108 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stau1Q9Z108 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stau1Q9Z108 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stau1Q9Z108 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stau1Q9Z108 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stau1Q9Z108 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stau1Q9Z108 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stau1Q9Z108 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stau1Q9Z108 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stau1Q9Z108 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stau1Q9Z108 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stau1Q9Z108 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stau1Q9Z108 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stau1Q9Z108 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stau1Q9Z108 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms