Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap4s1Q9WVL1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap4s1Q9WVL1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap4s1Q9WVL1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap4s1Q9WVL1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap4s1Q9WVL1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap4s1Q9WVL1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap4s1Q9WVL1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap4s1Q9WVL1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap4s1Q9WVL1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap4s1Q9WVL1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap4s1Q9WVL1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap4s1Q9WVL1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap4s1Q9WVL1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap4s1Q9WVL1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap4s1Q9WVL1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap4s1Q9WVL1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap4s1Q9WVL1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap4s1Q9WVL1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap4s1Q9WVL1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap4s1Q9WVL1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap4s1Q9WVL1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap4s1Q9WVL1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap4s1Q9WVL1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap4s1Q9WVL1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap4s1Q9WVL1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap4s1Q9WVL1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap4s1Q9WVL1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap4s1Q9WVL1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap4s1Q9WVL1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ap4s1Q9WVL1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Ap4s1Q9WVL1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap4s1Q9WVL1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap4s1Q9WVL1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ap4s1Q9WVL1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap4s1Q9WVL1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap4s1Q9WVL1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap4s1Q9WVL1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap4s1Q9WVL1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap4s1Q9WVL1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap4s1Q9WVL1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap4s1Q9WVL1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap4s1Q9WVL1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap4s1Q9WVL1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap4s1Q9WVL1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap4s1Q9WVL1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap4s1Q9WVL1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap4s1Q9WVL1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap4s1Q9WVL1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap4s1Q9WVL1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap4s1Q9WVL1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ap4s1Q9WVL1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ap4s1Q9WVL1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ap4s1Q9WVL1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ap4s1Q9WVL1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap4s1Q9WVL1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap4s1Q9WVL1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap4s1Q9WVL1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap4s1Q9WVL1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ap4s1Q9WVL1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap4s1Q9WVL1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap4s1Q9WVL1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap4s1Q9WVL1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap4s1Q9WVL1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap4s1Q9WVL1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap4s1Q9WVL1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap4s1Q9WVL1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap4s1Q9WVL1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap4s1Q9WVL1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap4s1Q9WVL1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap4s1Q9WVL1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap4s1Q9WVL1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap4s1Q9WVL1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ap4s1Q9WVL1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ap4s1Q9WVL1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ap4s1Q9WVL1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap4s1Q9WVL1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap4s1Q9WVL1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap4s1Q9WVL1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap4s1Q9WVL1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap4s1Q9WVL1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap4s1Q9WVL1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap4s1Q9WVL1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap4s1Q9WVL1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap4s1Q9WVL1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap4s1Q9WVL1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap4s1Q9WVL1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap4s1Q9WVL1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap4s1Q9WVL1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap4s1Q9WVL1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap4s1Q9WVL1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap4s1Q9WVL1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap4s1Q9WVL1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap4s1Q9WVL1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap4s1Q9WVL1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ap4s1Q9WVL1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ap4s1Q9WVL1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ap4s1Q9WVL1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ap4s1Q9WVL1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap4s1Q9WVL1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 612.1 ms