Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clcn5Q9WVD4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clcn5Q9WVD4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clcn5Q9WVD4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clcn5Q9WVD4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clcn5Q9WVD4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clcn5Q9WVD4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clcn5Q9WVD4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Clcn5Q9WVD4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clcn5Q9WVD4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Clcn5Q9WVD4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clcn5Q9WVD4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clcn5Q9WVD4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clcn5Q9WVD4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clcn5Q9WVD4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clcn5Q9WVD4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clcn5Q9WVD4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clcn5Q9WVD4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clcn5Q9WVD4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clcn5Q9WVD4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clcn5Q9WVD4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clcn5Q9WVD4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clcn5Q9WVD4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clcn5Q9WVD4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clcn5Q9WVD4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clcn5Q9WVD4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clcn5Q9WVD4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Clcn5Q9WVD4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clcn5Q9WVD4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clcn5Q9WVD4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clcn5Q9WVD4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clcn5Q9WVD4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clcn5Q9WVD4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clcn5Q9WVD4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clcn5Q9WVD4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clcn5Q9WVD4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clcn5Q9WVD4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clcn5Q9WVD4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clcn5Q9WVD4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clcn5Q9WVD4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clcn5Q9WVD4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clcn5Q9WVD4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clcn5Q9WVD4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clcn5Q9WVD4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clcn5Q9WVD4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clcn5Q9WVD4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clcn5Q9WVD4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clcn5Q9WVD4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clcn5Q9WVD4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clcn5Q9WVD4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clcn5Q9WVD4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clcn5Q9WVD4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clcn5Q9WVD4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clcn5Q9WVD4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Clcn5Q9WVD4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clcn5Q9WVD4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clcn5Q9WVD4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clcn5Q9WVD4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clcn5Q9WVD4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clcn5Q9WVD4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clcn5Q9WVD4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clcn5Q9WVD4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clcn5Q9WVD4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clcn5Q9WVD4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clcn5Q9WVD4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clcn5Q9WVD4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clcn5Q9WVD4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clcn5Q9WVD4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clcn5Q9WVD4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clcn5Q9WVD4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clcn5Q9WVD4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clcn5Q9WVD4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clcn5Q9WVD4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clcn5Q9WVD4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Clcn5Q9WVD4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clcn5Q9WVD4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clcn5Q9WVD4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clcn5Q9WVD4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clcn5Q9WVD4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clcn5Q9WVD4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clcn5Q9WVD4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clcn5Q9WVD4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clcn5Q9WVD4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clcn5Q9WVD4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clcn5Q9WVD4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clcn5Q9WVD4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clcn5Q9WVD4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clcn5Q9WVD4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clcn5Q9WVD4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clcn5Q9WVD4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clcn5Q9WVD4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clcn5Q9WVD4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clcn5Q9WVD4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clcn5Q9WVD4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Clcn5Q9WVD4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clcn5Q9WVD4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Clcn5Q9WVD4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clcn5Q9WVD4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clcn5Q9WVD4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clcn5Q9WVD4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms