Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ArcQ9WV31 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ArcQ9WV31 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ArcQ9WV31 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ArcQ9WV31 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ArcQ9WV31 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ArcQ9WV31 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ArcQ9WV31 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ArcQ9WV31 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ArcQ9WV31 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ArcQ9WV31 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ArcQ9WV31 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ArcQ9WV31 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ArcQ9WV31 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ArcQ9WV31 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ArcQ9WV31 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ArcQ9WV31 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ArcQ9WV31 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ArcQ9WV31 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ArcQ9WV31 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ArcQ9WV31 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ArcQ9WV31 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ArcQ9WV31 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ArcQ9WV31 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ArcQ9WV31 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ArcQ9WV31 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ArcQ9WV31 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ArcQ9WV31 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ArcQ9WV31 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ArcQ9WV31 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ArcQ9WV31 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ArcQ9WV31 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ArcQ9WV31 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ArcQ9WV31 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ArcQ9WV31 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
ArcQ9WV31 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ArcQ9WV31 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ArcQ9WV31 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ArcQ9WV31 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ArcQ9WV31 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ArcQ9WV31 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ArcQ9WV31 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ArcQ9WV31 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ArcQ9WV31 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ArcQ9WV31 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ArcQ9WV31 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ArcQ9WV31 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ArcQ9WV31 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ArcQ9WV31 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ArcQ9WV31 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ArcQ9WV31 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ArcQ9WV31 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ArcQ9WV31 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ArcQ9WV31 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ArcQ9WV31 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ArcQ9WV31 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ArcQ9WV31 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ArcQ9WV31 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ArcQ9WV31 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ArcQ9WV31 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ArcQ9WV31 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ArcQ9WV31 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ArcQ9WV31 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ArcQ9WV31 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ArcQ9WV31 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ArcQ9WV31 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ArcQ9WV31 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ArcQ9WV31 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ArcQ9WV31 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ArcQ9WV31 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ArcQ9WV31 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ArcQ9WV31 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ArcQ9WV31 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ArcQ9WV31 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ArcQ9WV31 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ArcQ9WV31 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ArcQ9WV31 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ArcQ9WV31 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ArcQ9WV31 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ArcQ9WV31 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ArcQ9WV31 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ArcQ9WV31 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ArcQ9WV31 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ArcQ9WV31 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ArcQ9WV31 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ArcQ9WV31 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ArcQ9WV31 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ArcQ9WV31 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ArcQ9WV31 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ArcQ9WV31 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ArcQ9WV31 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ArcQ9WV31 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ArcQ9WV31 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ArcQ9WV31 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ArcQ9WV31 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ArcQ9WV31 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ArcQ9WV31 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ArcQ9WV31 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ArcQ9WV31 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ArcQ9WV31 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms