Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUE3

Cyb561d2, Cytochrome b561 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d2Q9WUE3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyb561d2Q9WUE3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyb561d2Q9WUE3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyb561d2Q9WUE3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyb561d2Q9WUE3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyb561d2Q9WUE3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyb561d2Q9WUE3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyb561d2Q9WUE3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyb561d2Q9WUE3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyb561d2Q9WUE3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyb561d2Q9WUE3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyb561d2Q9WUE3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyb561d2Q9WUE3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyb561d2Q9WUE3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyb561d2Q9WUE3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cyb561d2Q9WUE3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyb561d2Q9WUE3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyb561d2Q9WUE3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyb561d2Q9WUE3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyb561d2Q9WUE3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyb561d2Q9WUE3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyb561d2Q9WUE3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyb561d2Q9WUE3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyb561d2Q9WUE3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyb561d2Q9WUE3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyb561d2Q9WUE3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyb561d2Q9WUE3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyb561d2Q9WUE3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyb561d2Q9WUE3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyb561d2Q9WUE3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyb561d2Q9WUE3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyb561d2Q9WUE3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyb561d2Q9WUE3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyb561d2Q9WUE3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyb561d2Q9WUE3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyb561d2Q9WUE3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyb561d2Q9WUE3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyb561d2Q9WUE3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyb561d2Q9WUE3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyb561d2Q9WUE3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyb561d2Q9WUE3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyb561d2Q9WUE3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyb561d2Q9WUE3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyb561d2Q9WUE3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyb561d2Q9WUE3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyb561d2Q9WUE3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyb561d2Q9WUE3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyb561d2Q9WUE3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyb561d2Q9WUE3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyb561d2Q9WUE3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyb561d2Q9WUE3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyb561d2Q9WUE3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyb561d2Q9WUE3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyb561d2Q9WUE3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyb561d2Q9WUE3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyb561d2Q9WUE3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyb561d2Q9WUE3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyb561d2Q9WUE3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyb561d2Q9WUE3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyb561d2Q9WUE3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyb561d2Q9WUE3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyb561d2Q9WUE3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyb561d2Q9WUE3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyb561d2Q9WUE3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyb561d2Q9WUE3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyb561d2Q9WUE3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyb561d2Q9WUE3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyb561d2Q9WUE3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyb561d2Q9WUE3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyb561d2Q9WUE3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyb561d2Q9WUE3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyb561d2Q9WUE3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cyb561d2Q9WUE3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyb561d2Q9WUE3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyb561d2Q9WUE3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyb561d2Q9WUE3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyb561d2Q9WUE3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyb561d2Q9WUE3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyb561d2Q9WUE3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyb561d2Q9WUE3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyb561d2Q9WUE3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyb561d2Q9WUE3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cyb561d2Q9WUE3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyb561d2Q9WUE3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyb561d2Q9WUE3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyb561d2Q9WUE3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyb561d2Q9WUE3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyb561d2Q9WUE3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyb561d2Q9WUE3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyb561d2Q9WUE3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyb561d2Q9WUE3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyb561d2Q9WUE3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyb561d2Q9WUE3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyb561d2Q9WUE3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyb561d2Q9WUE3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyb561d2Q9WUE3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyb561d2Q9WUE3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyb561d2Q9WUE3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyb561d2Q9WUE3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyb561d2Q9WUE3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms