Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pfdn5Q9WU28 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pfdn5Q9WU28 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pfdn5Q9WU28 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pfdn5Q9WU28 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pfdn5Q9WU28 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pfdn5Q9WU28 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Pfdn5Q9WU28 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pfdn5Q9WU28 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pfdn5Q9WU28 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pfdn5Q9WU28 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pfdn5Q9WU28 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pfdn5Q9WU28 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pfdn5Q9WU28 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pfdn5Q9WU28 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pfdn5Q9WU28 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pfdn5Q9WU28 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pfdn5Q9WU28 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pfdn5Q9WU28 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pfdn5Q9WU28 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pfdn5Q9WU28 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pfdn5Q9WU28 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pfdn5Q9WU28 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pfdn5Q9WU28 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pfdn5Q9WU28 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pfdn5Q9WU28 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pfdn5Q9WU28 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pfdn5Q9WU28 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pfdn5Q9WU28 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pfdn5Q9WU28 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pfdn5Q9WU28 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pfdn5Q9WU28 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pfdn5Q9WU28 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pfdn5Q9WU28 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pfdn5Q9WU28 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pfdn5Q9WU28 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pfdn5Q9WU28 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pfdn5Q9WU28 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pfdn5Q9WU28 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pfdn5Q9WU28 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pfdn5Q9WU28 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pfdn5Q9WU28 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pfdn5Q9WU28 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pfdn5Q9WU28 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pfdn5Q9WU28 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pfdn5Q9WU28 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pfdn5Q9WU28 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pfdn5Q9WU28 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pfdn5Q9WU28 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pfdn5Q9WU28 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pfdn5Q9WU28 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pfdn5Q9WU28 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pfdn5Q9WU28 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pfdn5Q9WU28 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pfdn5Q9WU28 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pfdn5Q9WU28 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pfdn5Q9WU28 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pfdn5Q9WU28 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pfdn5Q9WU28 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pfdn5Q9WU28 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pfdn5Q9WU28 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pfdn5Q9WU28 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pfdn5Q9WU28 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pfdn5Q9WU28 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pfdn5Q9WU28 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pfdn5Q9WU28 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pfdn5Q9WU28 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pfdn5Q9WU28 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pfdn5Q9WU28 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pfdn5Q9WU28 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pfdn5Q9WU28 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pfdn5Q9WU28 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pfdn5Q9WU28 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pfdn5Q9WU28 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pfdn5Q9WU28 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pfdn5Q9WU28 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pfdn5Q9WU28 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pfdn5Q9WU28 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pfdn5Q9WU28 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pfdn5Q9WU28 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pfdn5Q9WU28 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pfdn5Q9WU28 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms