Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vax2Q9WTP9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vax2Q9WTP9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Vax2Q9WTP9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vax2Q9WTP9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vax2Q9WTP9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Vax2Q9WTP9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vax2Q9WTP9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vax2Q9WTP9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vax2Q9WTP9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Vax2Q9WTP9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vax2Q9WTP9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vax2Q9WTP9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vax2Q9WTP9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vax2Q9WTP9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vax2Q9WTP9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vax2Q9WTP9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vax2Q9WTP9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vax2Q9WTP9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vax2Q9WTP9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vax2Q9WTP9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vax2Q9WTP9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vax2Q9WTP9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vax2Q9WTP9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vax2Q9WTP9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vax2Q9WTP9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vax2Q9WTP9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vax2Q9WTP9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vax2Q9WTP9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vax2Q9WTP9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Vax2Q9WTP9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vax2Q9WTP9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vax2Q9WTP9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vax2Q9WTP9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vax2Q9WTP9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vax2Q9WTP9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vax2Q9WTP9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vax2Q9WTP9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms