Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psmb2Q9R1P3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Psmb2Q9R1P3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psmb2Q9R1P3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb2Q9R1P3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psmb2Q9R1P3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb2Q9R1P3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb2Q9R1P3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psmb2Q9R1P3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb2Q9R1P3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb2Q9R1P3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb2Q9R1P3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb2Q9R1P3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb2Q9R1P3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb2Q9R1P3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb2Q9R1P3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb2Q9R1P3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb2Q9R1P3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb2Q9R1P3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb2Q9R1P3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb2Q9R1P3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb2Q9R1P3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb2Q9R1P3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb2Q9R1P3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Psmb2Q9R1P3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Psmb2Q9R1P3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb2Q9R1P3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb2Q9R1P3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb2Q9R1P3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb2Q9R1P3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb2Q9R1P3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb2Q9R1P3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb2Q9R1P3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb2Q9R1P3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb2Q9R1P3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb2Q9R1P3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb2Q9R1P3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb2Q9R1P3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb2Q9R1P3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb2Q9R1P3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb2Q9R1P3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb2Q9R1P3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb2Q9R1P3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb2Q9R1P3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb2Q9R1P3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb2Q9R1P3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb2Q9R1P3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb2Q9R1P3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Psmb2Q9R1P3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb2Q9R1P3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms