Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L1

Hsf4, Heat shock factor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf4Q9R0L1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hsf4Q9R0L1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hsf4Q9R0L1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hsf4Q9R0L1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hsf4Q9R0L1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hsf4Q9R0L1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hsf4Q9R0L1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hsf4Q9R0L1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hsf4Q9R0L1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hsf4Q9R0L1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hsf4Q9R0L1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hsf4Q9R0L1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hsf4Q9R0L1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hsf4Q9R0L1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hsf4Q9R0L1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hsf4Q9R0L1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hsf4Q9R0L1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hsf4Q9R0L1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hsf4Q9R0L1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hsf4Q9R0L1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hsf4Q9R0L1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hsf4Q9R0L1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hsf4Q9R0L1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hsf4Q9R0L1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hsf4Q9R0L1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hsf4Q9R0L1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hsf4Q9R0L1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hsf4Q9R0L1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hsf4Q9R0L1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hsf4Q9R0L1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hsf4Q9R0L1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hsf4Q9R0L1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hsf4Q9R0L1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hsf4Q9R0L1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hsf4Q9R0L1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hsf4Q9R0L1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hsf4Q9R0L1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hsf4Q9R0L1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hsf4Q9R0L1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hsf4Q9R0L1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hsf4Q9R0L1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hsf4Q9R0L1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hsf4Q9R0L1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hsf4Q9R0L1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hsf4Q9R0L1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hsf4Q9R0L1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hsf4Q9R0L1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hsf4Q9R0L1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hsf4Q9R0L1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hsf4Q9R0L1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hsf4Q9R0L1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hsf4Q9R0L1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hsf4Q9R0L1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hsf4Q9R0L1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hsf4Q9R0L1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hsf4Q9R0L1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hsf4Q9R0L1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hsf4Q9R0L1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hsf4Q9R0L1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hsf4Q9R0L1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hsf4Q9R0L1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hsf4Q9R0L1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hsf4Q9R0L1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hsf4Q9R0L1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hsf4Q9R0L1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hsf4Q9R0L1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hsf4Q9R0L1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hsf4Q9R0L1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hsf4Q9R0L1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hsf4Q9R0L1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hsf4Q9R0L1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hsf4Q9R0L1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms