Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prkab1Q9R078 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prkab1Q9R078 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prkab1Q9R078 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prkab1Q9R078 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prkab1Q9R078 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Prkab1Q9R078 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prkab1Q9R078 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prkab1Q9R078 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prkab1Q9R078 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Prkab1Q9R078 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prkab1Q9R078 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prkab1Q9R078 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prkab1Q9R078 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prkab1Q9R078 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prkab1Q9R078 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prkab1Q9R078 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prkab1Q9R078 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Prkab1Q9R078 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prkab1Q9R078 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prkab1Q9R078 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prkab1Q9R078 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prkab1Q9R078 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prkab1Q9R078 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Prkab1Q9R078 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prkab1Q9R078 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prkab1Q9R078 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prkab1Q9R078 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prkab1Q9R078 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prkab1Q9R078 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prkab1Q9R078 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prkab1Q9R078 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prkab1Q9R078 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prkab1Q9R078 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prkab1Q9R078 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prkab1Q9R078 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prkab1Q9R078 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prkab1Q9R078 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prkab1Q9R078 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prkab1Q9R078 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prkab1Q9R078 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prkab1Q9R078 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prkab1Q9R078 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prkab1Q9R078 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prkab1Q9R078 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prkab1Q9R078 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Prkab1Q9R078 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Prkab1Q9R078 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Prkab1Q9R078 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prkab1Q9R078 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prkab1Q9R078 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prkab1Q9R078 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prkab1Q9R078 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prkab1Q9R078 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prkab1Q9R078 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prkab1Q9R078 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Prkab1Q9R078 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prkab1Q9R078 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prkab1Q9R078 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Prkab1Q9R078 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Prkab1Q9R078 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Prkab1Q9R078 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Prkab1Q9R078 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prkab1Q9R078 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Prkab1Q9R078 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Prkab1Q9R078 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Prkab1Q9R078 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prkab1Q9R078 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prkab1Q9R078 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prkab1Q9R078 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Prkab1Q9R078 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Prkab1Q9R078 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prkab1Q9R078 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Prkab1Q9R078 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prkab1Q9R078 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Prkab1Q9R078 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prkab1Q9R078 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prkab1Q9R078 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Prkab1Q9R078 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prkab1Q9R078 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prkab1Q9R078 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Prkab1Q9R078 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Prkab1Q9R078 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prkab1Q9R078 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Prkab1Q9R078 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prkab1Q9R078 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prkab1Q9R078 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prkab1Q9R078 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prkab1Q9R078 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prkab1Q9R078 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prkab1Q9R078 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prkab1Q9R078 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prkab1Q9R078 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prkab1Q9R078 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prkab1Q9R078 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prkab1Q9R078 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prkab1Q9R078 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Prkab1Q9R078 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prkab1Q9R078 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Prkab1Q9R078 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms