Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtsjQ9R014 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtsjQ9R014 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtsjQ9R014 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CtsjQ9R014 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtsjQ9R014 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtsjQ9R014 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtsjQ9R014 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsjQ9R014 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsjQ9R014 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsjQ9R014 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsjQ9R014 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsjQ9R014 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsjQ9R014 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtsjQ9R014 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtsjQ9R014 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtsjQ9R014 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtsjQ9R014 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtsjQ9R014 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtsjQ9R014 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtsjQ9R014 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtsjQ9R014 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtsjQ9R014 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsjQ9R014 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtsjQ9R014 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CtsjQ9R014 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CtsjQ9R014 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtsjQ9R014 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtsjQ9R014 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtsjQ9R014 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtsjQ9R014 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtsjQ9R014 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtsjQ9R014 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtsjQ9R014 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtsjQ9R014 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtsjQ9R014 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtsjQ9R014 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtsjQ9R014 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtsjQ9R014 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CtsjQ9R014 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CtsjQ9R014 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtsjQ9R014 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtsjQ9R014 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CtsjQ9R014 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CtsjQ9R014 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtsjQ9R014 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CtsjQ9R014 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CtsjQ9R014 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CtsjQ9R014 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CtsjQ9R014 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtsjQ9R014 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtsjQ9R014 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CtsjQ9R014 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CtsjQ9R014 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CtsjQ9R014 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CtsjQ9R014 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtsjQ9R014 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtsjQ9R014 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CtsjQ9R014 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtsjQ9R014 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtsjQ9R014 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtsjQ9R014 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtsjQ9R014 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtsjQ9R014 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtsjQ9R014 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtsjQ9R014 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtsjQ9R014 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtsjQ9R014 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtsjQ9R014 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtsjQ9R014 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtsjQ9R014 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtsjQ9R014 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtsjQ9R014 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtsjQ9R014 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtsjQ9R014 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtsjQ9R014 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtsjQ9R014 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtsjQ9R014 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CtsjQ9R014 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CtsjQ9R014 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtsjQ9R014 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtsjQ9R014 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtsjQ9R014 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtsjQ9R014 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtsjQ9R014 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsjQ9R014 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsjQ9R014 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsjQ9R014 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsjQ9R014 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsjQ9R014 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtsjQ9R014 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtsjQ9R014 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtsjQ9R014 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtsjQ9R014 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtsjQ9R014 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtsjQ9R014 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtsjQ9R014 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtsjQ9R014 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtsjQ9R014 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtsjQ9R014 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms