Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZV9

Nxt1, NTF2-related export protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxt1Q9QZV9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nxt1Q9QZV9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxt1Q9QZV9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxt1Q9QZV9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxt1Q9QZV9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxt1Q9QZV9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nxt1Q9QZV9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nxt1Q9QZV9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nxt1Q9QZV9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nxt1Q9QZV9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nxt1Q9QZV9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nxt1Q9QZV9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nxt1Q9QZV9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nxt1Q9QZV9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nxt1Q9QZV9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nxt1Q9QZV9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nxt1Q9QZV9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nxt1Q9QZV9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nxt1Q9QZV9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nxt1Q9QZV9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxt1Q9QZV9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxt1Q9QZV9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxt1Q9QZV9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxt1Q9QZV9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nxt1Q9QZV9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nxt1Q9QZV9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nxt1Q9QZV9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nxt1Q9QZV9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nxt1Q9QZV9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nxt1Q9QZV9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nxt1Q9QZV9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nxt1Q9QZV9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nxt1Q9QZV9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nxt1Q9QZV9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nxt1Q9QZV9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nxt1Q9QZV9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nxt1Q9QZV9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nxt1Q9QZV9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nxt1Q9QZV9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nxt1Q9QZV9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nxt1Q9QZV9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nxt1Q9QZV9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nxt1Q9QZV9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nxt1Q9QZV9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nxt1Q9QZV9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nxt1Q9QZV9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nxt1Q9QZV9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nxt1Q9QZV9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nxt1Q9QZV9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nxt1Q9QZV9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nxt1Q9QZV9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nxt1Q9QZV9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nxt1Q9QZV9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nxt1Q9QZV9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nxt1Q9QZV9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nxt1Q9QZV9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nxt1Q9QZV9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nxt1Q9QZV9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nxt1Q9QZV9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nxt1Q9QZV9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nxt1Q9QZV9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nxt1Q9QZV9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nxt1Q9QZV9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nxt1Q9QZV9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nxt1Q9QZV9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nxt1Q9QZV9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nxt1Q9QZV9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nxt1Q9QZV9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nxt1Q9QZV9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nxt1Q9QZV9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nxt1Q9QZV9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nxt1Q9QZV9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nxt1Q9QZV9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nxt1Q9QZV9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nxt1Q9QZV9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nxt1Q9QZV9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nxt1Q9QZV9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nxt1Q9QZV9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nxt1Q9QZV9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nxt1Q9QZV9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nxt1Q9QZV9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nxt1Q9QZV9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nxt1Q9QZV9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nxt1Q9QZV9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nxt1Q9QZV9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nxt1Q9QZV9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nxt1Q9QZV9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nxt1Q9QZV9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nxt1Q9QZV9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nxt1Q9QZV9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nxt1Q9QZV9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nxt1Q9QZV9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nxt1Q9QZV9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nxt1Q9QZV9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nxt1Q9QZV9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nxt1Q9QZV9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nxt1Q9QZV9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nxt1Q9QZV9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nxt1Q9QZV9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nxt1Q9QZV9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms