Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZN4

Fbxo6, F-box only protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo6Q9QZN4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo6Q9QZN4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo6Q9QZN4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo6Q9QZN4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo6Q9QZN4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo6Q9QZN4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo6Q9QZN4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo6Q9QZN4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo6Q9QZN4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbxo6Q9QZN4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbxo6Q9QZN4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fbxo6Q9QZN4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo6Q9QZN4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo6Q9QZN4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo6Q9QZN4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo6Q9QZN4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo6Q9QZN4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo6Q9QZN4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo6Q9QZN4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbxo6Q9QZN4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo6Q9QZN4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo6Q9QZN4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxo6Q9QZN4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxo6Q9QZN4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo6Q9QZN4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo6Q9QZN4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo6Q9QZN4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo6Q9QZN4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo6Q9QZN4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo6Q9QZN4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo6Q9QZN4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo6Q9QZN4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo6Q9QZN4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxo6Q9QZN4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxo6Q9QZN4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxo6Q9QZN4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxo6Q9QZN4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo6Q9QZN4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo6Q9QZN4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxo6Q9QZN4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo6Q9QZN4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo6Q9QZN4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxo6Q9QZN4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo6Q9QZN4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo6Q9QZN4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo6Q9QZN4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo6Q9QZN4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo6Q9QZN4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo6Q9QZN4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo6Q9QZN4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo6Q9QZN4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo6Q9QZN4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo6Q9QZN4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo6Q9QZN4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo6Q9QZN4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo6Q9QZN4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo6Q9QZN4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo6Q9QZN4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fbxo6Q9QZN4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo6Q9QZN4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo6Q9QZN4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo6Q9QZN4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo6Q9QZN4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo6Q9QZN4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo6Q9QZN4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo6Q9QZN4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo6Q9QZN4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo6Q9QZN4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo6Q9QZN4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo6Q9QZN4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo6Q9QZN4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo6Q9QZN4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo6Q9QZN4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo6Q9QZN4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo6Q9QZN4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo6Q9QZN4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo6Q9QZN4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo6Q9QZN4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fbxo6Q9QZN4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Fbxo6Q9QZN4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fbxo6Q9QZN4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo6Q9QZN4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo6Q9QZN4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo6Q9QZN4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo6Q9QZN4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo6Q9QZN4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo6Q9QZN4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo6Q9QZN4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo6Q9QZN4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo6Q9QZN4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo6Q9QZN4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo6Q9QZN4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo6Q9QZN4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo6Q9QZN4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo6Q9QZN4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo6Q9QZN4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo6Q9QZN4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo6Q9QZN4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo6Q9QZN4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo6Q9QZN4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms