Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ripk3Q9QZL0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ripk3Q9QZL0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ripk3Q9QZL0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ripk3Q9QZL0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ripk3Q9QZL0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ripk3Q9QZL0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ripk3Q9QZL0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ripk3Q9QZL0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ripk3Q9QZL0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ripk3Q9QZL0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ripk3Q9QZL0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ripk3Q9QZL0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ripk3Q9QZL0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ripk3Q9QZL0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ripk3Q9QZL0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ripk3Q9QZL0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ripk3Q9QZL0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ripk3Q9QZL0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ripk3Q9QZL0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ripk3Q9QZL0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ripk3Q9QZL0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Ripk3Q9QZL0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ripk3Q9QZL0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ripk3Q9QZL0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ripk3Q9QZL0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ripk3Q9QZL0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ripk3Q9QZL0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ripk3Q9QZL0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ripk3Q9QZL0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ripk3Q9QZL0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ripk3Q9QZL0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ripk3Q9QZL0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ripk3Q9QZL0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ripk3Q9QZL0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ripk3Q9QZL0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ripk3Q9QZL0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ripk3Q9QZL0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ripk3Q9QZL0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ripk3Q9QZL0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ripk3Q9QZL0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ripk3Q9QZL0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ripk3Q9QZL0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ripk3Q9QZL0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ripk3Q9QZL0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ripk3Q9QZL0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ripk3Q9QZL0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ripk3Q9QZL0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ripk3Q9QZL0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ripk3Q9QZL0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ripk3Q9QZL0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ripk3Q9QZL0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ripk3Q9QZL0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ripk3Q9QZL0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ripk3Q9QZL0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ripk3Q9QZL0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ripk3Q9QZL0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ripk3Q9QZL0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ripk3Q9QZL0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ripk3Q9QZL0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ripk3Q9QZL0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ripk3Q9QZL0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ripk3Q9QZL0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ripk3Q9QZL0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ripk3Q9QZL0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ripk3Q9QZL0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ripk3Q9QZL0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ripk3Q9QZL0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ripk3Q9QZL0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ripk3Q9QZL0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ripk3Q9QZL0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ripk3Q9QZL0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ripk3Q9QZL0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ripk3Q9QZL0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ripk3Q9QZL0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ripk3Q9QZL0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ripk3Q9QZL0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ripk3Q9QZL0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ripk3Q9QZL0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ripk3Q9QZL0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ripk3Q9QZL0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ripk3Q9QZL0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ripk3Q9QZL0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ripk3Q9QZL0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ripk3Q9QZL0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ripk3Q9QZL0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ripk3Q9QZL0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ripk3Q9QZL0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ripk3Q9QZL0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ripk3Q9QZL0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ripk3Q9QZL0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ripk3Q9QZL0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ripk3Q9QZL0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ripk3Q9QZL0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ripk3Q9QZL0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ripk3Q9QZL0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ripk3Q9QZL0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ripk3Q9QZL0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ripk3Q9QZL0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ripk3Q9QZL0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms