Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim44Q9QXA7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim44Q9QXA7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim44Q9QXA7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim44Q9QXA7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim44Q9QXA7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim44Q9QXA7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim44Q9QXA7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim44Q9QXA7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim44Q9QXA7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim44Q9QXA7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim44Q9QXA7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim44Q9QXA7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim44Q9QXA7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim44Q9QXA7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim44Q9QXA7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim44Q9QXA7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim44Q9QXA7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim44Q9QXA7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim44Q9QXA7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim44Q9QXA7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim44Q9QXA7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim44Q9QXA7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trim44Q9QXA7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim44Q9QXA7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim44Q9QXA7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim44Q9QXA7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim44Q9QXA7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim44Q9QXA7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim44Q9QXA7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim44Q9QXA7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim44Q9QXA7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim44Q9QXA7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim44Q9QXA7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim44Q9QXA7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim44Q9QXA7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim44Q9QXA7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim44Q9QXA7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Trim44Q9QXA7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim44Q9QXA7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim44Q9QXA7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim44Q9QXA7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim44Q9QXA7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim44Q9QXA7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim44Q9QXA7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim44Q9QXA7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim44Q9QXA7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim44Q9QXA7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim44Q9QXA7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim44Q9QXA7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim44Q9QXA7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim44Q9QXA7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim44Q9QXA7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim44Q9QXA7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim44Q9QXA7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim44Q9QXA7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim44Q9QXA7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim44Q9QXA7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim44Q9QXA7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim44Q9QXA7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim44Q9QXA7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim44Q9QXA7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim44Q9QXA7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim44Q9QXA7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim44Q9QXA7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim44Q9QXA7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim44Q9QXA7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim44Q9QXA7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim44Q9QXA7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim44Q9QXA7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim44Q9QXA7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim44Q9QXA7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim44Q9QXA7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim44Q9QXA7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim44Q9QXA7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim44Q9QXA7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim44Q9QXA7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim44Q9QXA7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim44Q9QXA7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim44Q9QXA7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim44Q9QXA7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim44Q9QXA7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim44Q9QXA7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim44Q9QXA7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim44Q9QXA7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim44Q9QXA7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim44Q9QXA7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim44Q9QXA7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim44Q9QXA7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim44Q9QXA7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim44Q9QXA7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim44Q9QXA7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim44Q9QXA7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim44Q9QXA7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim44Q9QXA7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim44Q9QXA7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim44Q9QXA7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim44Q9QXA7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trim44Q9QXA7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trim44Q9QXA7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms