Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Chaf1aQ9QWF0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chaf1aQ9QWF0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chaf1aQ9QWF0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chaf1aQ9QWF0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chaf1aQ9QWF0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chaf1aQ9QWF0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Chaf1aQ9QWF0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Chaf1aQ9QWF0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chaf1aQ9QWF0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chaf1aQ9QWF0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Chaf1aQ9QWF0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chaf1aQ9QWF0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chaf1aQ9QWF0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chaf1aQ9QWF0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chaf1aQ9QWF0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Chaf1aQ9QWF0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Chaf1aQ9QWF0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Chaf1aQ9QWF0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chaf1aQ9QWF0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms