Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUQ5

Trpc4, Short transient receptor potential channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4Q9QUQ5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpc4Q9QUQ5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpc4Q9QUQ5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpc4Q9QUQ5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpc4Q9QUQ5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpc4Q9QUQ5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpc4Q9QUQ5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpc4Q9QUQ5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpc4Q9QUQ5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpc4Q9QUQ5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpc4Q9QUQ5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpc4Q9QUQ5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpc4Q9QUQ5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpc4Q9QUQ5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpc4Q9QUQ5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpc4Q9QUQ5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpc4Q9QUQ5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpc4Q9QUQ5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpc4Q9QUQ5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpc4Q9QUQ5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpc4Q9QUQ5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpc4Q9QUQ5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpc4Q9QUQ5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpc4Q9QUQ5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpc4Q9QUQ5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpc4Q9QUQ5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpc4Q9QUQ5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpc4Q9QUQ5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc4Q9QUQ5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc4Q9QUQ5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc4Q9QUQ5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc4Q9QUQ5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpc4Q9QUQ5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpc4Q9QUQ5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpc4Q9QUQ5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpc4Q9QUQ5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpc4Q9QUQ5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc4Q9QUQ5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc4Q9QUQ5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpc4Q9QUQ5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc4Q9QUQ5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc4Q9QUQ5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc4Q9QUQ5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc4Q9QUQ5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpc4Q9QUQ5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trpc4Q9QUQ5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trpc4Q9QUQ5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpc4Q9QUQ5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpc4Q9QUQ5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpc4Q9QUQ5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc4Q9QUQ5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc4Q9QUQ5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc4Q9QUQ5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc4Q9QUQ5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc4Q9QUQ5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc4Q9QUQ5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc4Q9QUQ5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpc4Q9QUQ5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpc4Q9QUQ5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpc4Q9QUQ5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc4Q9QUQ5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc4Q9QUQ5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc4Q9QUQ5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc4Q9QUQ5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpc4Q9QUQ5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpc4Q9QUQ5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpc4Q9QUQ5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpc4Q9QUQ5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc4Q9QUQ5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc4Q9QUQ5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpc4Q9QUQ5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpc4Q9QUQ5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc4Q9QUQ5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc4Q9QUQ5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc4Q9QUQ5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc4Q9QUQ5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc4Q9QUQ5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc4Q9QUQ5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpc4Q9QUQ5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpc4Q9QUQ5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpc4Q9QUQ5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc4Q9QUQ5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc4Q9QUQ5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc4Q9QUQ5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc4Q9QUQ5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trpc4Q9QUQ5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc4Q9QUQ5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms